Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIPA1Q96FS4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIPA1Q96FS4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIPA1Q96FS4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms