Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00526Q96FQ7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00526Q96FQ7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms