Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERP27Q96DN0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERP27Q96DN0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms