Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FAM3DQ96BQ1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
FAM3DQ96BQ1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms