Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VTI1AQ96AJ9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms