Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC17Q96AE7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC17Q96AE7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTC17Q96AE7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 276 ms