Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PRG4Q92954 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PRG4Q92954 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRG4Q92954 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms