Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA4DQ92854 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA4DQ92854 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA4DQ92854 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms