Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FRAT1Q92837 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FRAT1Q92837 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FRAT1Q92837 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FRAT1Q92837 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FRAT1Q92837 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FRAT1Q92837 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FRAT1Q92837 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FRAT1Q92837 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FRAT1Q92837 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FRAT1Q92837 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FRAT1Q92837 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FRAT1Q92837 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FRAT1Q92837 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FRAT1Q92837 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
FRAT1Q92837 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRAT1Q92837 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms