Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF516Q92618 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF516Q92618 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF516Q92618 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms