Protein–RNA interactions for Protein: Q92562

FIG4, Polyphosphoinositide phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FIG4Q92562 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FIG4Q92562 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FIG4Q92562 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FIG4Q92562 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FIG4Q92562 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FIG4Q92562 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FIG4Q92562 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FIG4Q92562 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FIG4Q92562 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FIG4Q92562 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FIG4Q92562 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FIG4Q92562 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FIG4Q92562 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FIG4Q92562 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FIG4Q92562 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FIG4Q92562 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FIG4Q92562 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FIG4Q92562 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FIG4Q92562 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FIG4Q92562 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FIG4Q92562 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FIG4Q92562 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FIG4Q92562 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FIG4Q92562 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FIG4Q92562 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FIG4Q92562 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FIG4Q92562 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FIG4Q92562 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FIG4Q92562 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FIG4Q92562 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FIG4Q92562 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FIG4Q92562 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FIG4Q92562 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FIG4Q92562 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FIG4Q92562 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FIG4Q92562 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FIG4Q92562 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FIG4Q92562 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FIG4Q92562 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FIG4Q92562 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FIG4Q92562 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FIG4Q92562 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FIG4Q92562 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FIG4Q92562 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FIG4Q92562 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FIG4Q92562 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FIG4Q92562 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FIG4Q92562 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FIG4Q92562 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FIG4Q92562 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FIG4Q92562 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FIG4Q92562 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FIG4Q92562 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FIG4Q92562 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FIG4Q92562 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FIG4Q92562 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FIG4Q92562 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FIG4Q92562 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FIG4Q92562 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms