Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PYDC1Q8WXC3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PYDC1Q8WXC3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms