Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBLCP1Q8WVY7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBLCP1Q8WVY7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms