Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HELQQ8TDG4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HELQQ8TDG4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms