Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDX54Q8TDD1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDX54Q8TDD1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDX54Q8TDD1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms