Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CCER1Q8TC90 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCER1Q8TC90 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCER1Q8TC90 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCER1Q8TC90 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCER1Q8TC90 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCER1Q8TC90 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCER1Q8TC90 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCER1Q8TC90 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCER1Q8TC90 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCER1Q8TC90 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CCER1Q8TC90 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCER1Q8TC90 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCER1Q8TC90 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms