Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
KLHDC4Q8TBB5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KLHDC4Q8TBB5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms