Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CFAP61Q8NHU2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP61Q8NHU2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms