Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HELBQ8NG08 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
HELBQ8NG08 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
HELBQ8NG08 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HELBQ8NG08 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HELBQ8NG08 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HELBQ8NG08 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HELBQ8NG08 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HELBQ8NG08 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HELBQ8NG08 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HELBQ8NG08 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HELBQ8NG08 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HELBQ8NG08 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HELBQ8NG08 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HELBQ8NG08 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HELBQ8NG08 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HELBQ8NG08 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HELBQ8NG08 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
HELBQ8NG08 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
HELBQ8NG08 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HELBQ8NG08 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HELBQ8NG08 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HELBQ8NG08 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HELBQ8NG08 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HELBQ8NG08 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HELBQ8NG08 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HELBQ8NG08 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HELBQ8NG08 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HELBQ8NG08 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HELBQ8NG08 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HELBQ8NG08 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HELBQ8NG08 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HELBQ8NG08 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HELBQ8NG08 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HELBQ8NG08 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HELBQ8NG08 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HELBQ8NG08 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HELBQ8NG08 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HELBQ8NG08 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
HELBQ8NG08 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HELBQ8NG08 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HELBQ8NG08 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HELBQ8NG08 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HELBQ8NG08 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HELBQ8NG08 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HELBQ8NG08 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HELBQ8NG08 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HELBQ8NG08 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HELBQ8NG08 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HELBQ8NG08 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HELBQ8NG08 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HELBQ8NG08 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HELBQ8NG08 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HELBQ8NG08 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HELBQ8NG08 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HELBQ8NG08 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HELBQ8NG08 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HELBQ8NG08 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HELBQ8NG08 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HELBQ8NG08 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HELBQ8NG08 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HELBQ8NG08 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HELBQ8NG08 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HELBQ8NG08 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HELBQ8NG08 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms