Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LPCAT1Q8NF37 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT1Q8NF37 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT1Q8NF37 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms