Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PIK3C3Q8NEB9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms