Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCY6

MSANTD4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD4Q8NCY6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD4Q8NCY6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD4Q8NCY6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD4Q8NCY6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD4Q8NCY6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD4Q8NCY6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD4Q8NCY6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD4Q8NCY6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD4Q8NCY6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD4Q8NCY6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD4Q8NCY6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSANTD4Q8NCY6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MSANTD4Q8NCY6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MSANTD4Q8NCY6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MSANTD4Q8NCY6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSANTD4Q8NCY6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSANTD4Q8NCY6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MSANTD4Q8NCY6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSANTD4Q8NCY6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSANTD4Q8NCY6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSANTD4Q8NCY6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSANTD4Q8NCY6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MSANTD4Q8NCY6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSANTD4Q8NCY6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSANTD4Q8NCY6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSANTD4Q8NCY6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSANTD4Q8NCY6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSANTD4Q8NCY6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MSANTD4Q8NCY6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSANTD4Q8NCY6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MSANTD4Q8NCY6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms