Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC63Q8NA47 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC63Q8NA47 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms