Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PNPLA1Q8N8W4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PNPLA1Q8N8W4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PNPLA1Q8N8W4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms