Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00612Q8N6U2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms