Protein–RNA interactions for Protein: Q8N414

PGBD5, PiggyBac transposable element-derived protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD5Q8N414 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGBD5Q8N414 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms