Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHTF2Q8N3S3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHTF2Q8N3S3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms