Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPM1KQ8N3J5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1KQ8N3J5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1KQ8N3J5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms