Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2I9

STK40, Serine/threonine-protein kinase 40, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STK40Q8N2I9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STK40Q8N2I9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STK40Q8N2I9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
STK40Q8N2I9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STK40Q8N2I9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STK40Q8N2I9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STK40Q8N2I9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STK40Q8N2I9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STK40Q8N2I9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STK40Q8N2I9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STK40Q8N2I9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STK40Q8N2I9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STK40Q8N2I9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STK40Q8N2I9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STK40Q8N2I9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STK40Q8N2I9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STK40Q8N2I9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STK40Q8N2I9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STK40Q8N2I9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STK40Q8N2I9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STK40Q8N2I9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STK40Q8N2I9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STK40Q8N2I9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STK40Q8N2I9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms