Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSTM4Q8IW00 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VSTM4Q8IW00 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM4Q8IW00 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM4Q8IW00 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM4Q8IW00 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM4Q8IW00 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM4Q8IW00 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM4Q8IW00 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM4Q8IW00 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSTM4Q8IW00 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms