Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
APOBEC3FQ8IUX4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
APOBEC3FQ8IUX4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
APOBEC3FQ8IUX4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms