Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DZIP3Q86Y13 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DZIP3Q86Y13 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms