Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATG4DQ86TL0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG4DQ86TL0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms