Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO2Q7Z6W1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO2Q7Z6W1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO2Q7Z6W1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO2Q7Z6W1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO2Q7Z6W1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMCO2Q7Z6W1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO2Q7Z6W1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO2Q7Z6W1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO2Q7Z6W1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO2Q7Z6W1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO2Q7Z6W1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO2Q7Z6W1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO2Q7Z6W1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMCO2Q7Z6W1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO2Q7Z6W1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO2Q7Z6W1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms