Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
RBBP6Q7Z6E9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RBBP6Q7Z6E9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBBP6Q7Z6E9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBBP6Q7Z6E9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBBP6Q7Z6E9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBBP6Q7Z6E9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBBP6Q7Z6E9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBBP6Q7Z6E9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RBBP6Q7Z6E9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBBP6Q7Z6E9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBBP6Q7Z6E9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBBP6Q7Z6E9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBBP6Q7Z6E9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RBBP6Q7Z6E9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RBBP6Q7Z6E9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RBBP6Q7Z6E9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBBP6Q7Z6E9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBBP6Q7Z6E9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBBP6Q7Z6E9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBBP6Q7Z6E9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBBP6Q7Z6E9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RBBP6Q7Z6E9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms