Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE3BQ7Z3V4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
UBE3BQ7Z3V4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE3BQ7Z3V4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms