Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MICAL3Q7RTP6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MICAL3Q7RTP6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MICAL3Q7RTP6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MICAL3Q7RTP6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MICAL3Q7RTP6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MICAL3Q7RTP6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms