Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUFY3Q7L099 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RUFY3Q7L099 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY3Q7L099 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms