Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYDE1Q6ZW31 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYDE1Q6ZW31 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms