Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf139Q6ZV77 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf139Q6ZV77 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms