Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC149Q6ZUS6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC149Q6ZUS6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms