Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTI6

RFLNA, Refilin-A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFLNAQ6ZTI6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFLNAQ6ZTI6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFLNAQ6ZTI6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFLNAQ6ZTI6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 537.9 ms