Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC129Q6ZRS4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC129Q6ZRS4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC129Q6ZRS4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms