Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM136Q6ZRR5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM136Q6ZRR5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM136Q6ZRR5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM136Q6ZRR5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM136Q6ZRR5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM136Q6ZRR5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM136Q6ZRR5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM136Q6ZRR5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM136Q6ZRR5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM136Q6ZRR5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM136Q6ZRR5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM136Q6ZRR5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM136Q6ZRR5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM136Q6ZRR5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM136Q6ZRR5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM136Q6ZRR5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM136Q6ZRR5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM136Q6ZRR5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms