Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HACD2Q6Y1H2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HACD2Q6Y1H2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms