Protein–RNA interactions for Protein: Q6WBX8

RAD9B, Cell cycle checkpoint control protein RAD9B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9BQ6WBX8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD9BQ6WBX8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAD9BQ6WBX8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms