Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PACS1Q6VY07 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACS1Q6VY07 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms