Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC5Q6UXY8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMC5Q6UXY8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TMC5Q6UXY8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms