Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SARM1Q6SZW1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SARM1Q6SZW1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SARM1Q6SZW1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms