Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAF7Q6Q0C0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAF7Q6Q0C0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF7Q6Q0C0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms